Hebreeuws 'Jahweh geeft, geschenk van God'. De Griekse vorm is Jonathas. Vgl. voor de betekenis van de naam Nathanaël, Theodorus en Adeodatus. De naam komt verscheidene malen voor in het Oude Testament, maar het bekendst is Jonathan, de zoon van Saul, boezemvriend van David (1 Samuel 13 en 14). Al vroeg in de Middeleeuwen is de naam in gebruik: Jonathas, Rheinland omstreeks 865 (Littger), Gent 1118 (Tavernier Vereecken); Jonathas, ministerialis van de bisschop van Utrecht 1119; Jonathas, kanunnik van St.-Maarten in Utrecht 1156 (Gysseling 1966, 10). Na de Reformatie kwam de naam in gebruik in Engeland (bijvoorbeeld Jonathan Swift, schrijver van 'Gulliver's Travels'); ook in de VS komt hij voor.